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云冈学学院的历史最早可追溯到原雁北师专政史科（当时学校位于朔州市朔城区神头镇吉庄村）。政史科是1975年8月学校重新恢复招生的四个专业教学科之一，1986年随学校一起搬迁至大同市现址，1988年7月，政史科更名为政史系。

1993年9月，随着雁北师专升格为雁北师范学院，政史系名称变为历史系，同年9月开始招收历史专业本科生。2000年9月为适应地方经济社会发展的需要，增设旅游管理专业。2002年9月又增设工商管理专业。历史系发展为拥有历史、旅游管理、工商管理三个专业的系部。

2006年7月，随着原雁北师范学院、大同医学专科学校、大同职业技术学院、大同煤炭学校组建为山西大同大学，历史系一分为二，历史专业整合到新组建的文史学院，旅游管理专业和工商管理专业整合到当时组建的商学院。

2013年1月，学校对院系进行调整，历史系脱离文史学院（文史学院由此更名为文学院），旅游管理系脱离商学院，两系重新合并组建了历史与旅游文化学院。2013年4月，历史系增设文物保护技术专业，并于同年9月开始招生。历史与旅游文化学院便成了拥有历史学、文物保护技术和旅游管理三个本科专业的学院。

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2020年5月11日,习近平总书记来大同云冈石窟视察，发表了重要讲话和重要指示。为贯彻落实习近平总书记视察云冈石窟时的重要讲话和重要指示精神,贯彻落实省委书记楼阳生关于构建“云冈学”的战略构想,贯彻落实大同市委市政府关于加强云冈学研究的思想, 8月，山西省教育厅批准山西大同大学建设云冈学学院。9月9日，学校隆重举行了云冈学学院成立的揭牌仪式，云冈学学院正式成立。云冈学学院的成立，是山西大同大学贯彻落实习近平总书记视察山西重要讲话重要指示精神的一项重大举措，是学校按照省委省政府决策部署进行云冈学研究和人才培养，助推山西转型发展的重大进展，也是山西大同大学调整优化专业和学科结构的关键步伐，在学院的发展历史上具有里程碑意义。

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